Pregled i raspored trenutnih modula kao i njihovih sfera istrazivanja:
Modul za kvantitativnu ekonomiju
Modul za poslovne finansije i bankarstvo
Modul za računovodstvo i reviziju
Modul za međunarodnu ekonomiju
Modul za javne finansije, korporativno upravljanje ,osiguranje i javnu upravu
Modul za upravljanje projektima, preduzetništvo i biznis
Modul za marketing istraživanja
Modul za poreze, carine i akcize
Modul za logistiku i proizvodni menadžment
Modul za upravljanje kvalitetom
Modul za makroekonomsku politiku, razvoj i evropske studije
Modul za migracijske studije
Modul za geopolitiku i ekonomsku diplomatiju
Naučnoistraživački institut
Naučnoistraživački institut organizovan je kao zasebna organizaciona jedinica u sastavu Panevropskog univerziteta „APEIRON“ Banja Luka. Rješenjem Ministarstva nauke i tehnologije u Banjoj Luci broj 06/6-040/050-3/08 od 11.03.2008. godine Naučno-istraživački institut Univerziteta „APEIRON“ u Banjoj Luci dobio je odobrenje za rad i upisan u knjigu registra naučnoistraživačkih ustanova.